李道纯主张三教合一。认为《老子》、《周易》为群经之首，提出“真常之道”——即老子之道，有五种特性：无名无言;永恒不变;清净无为;变动有则;顺应中和。在内丹理论上，亦以此为理论基础。

　　李道纯在修炼程序上主张先性后命，“先持成定慧而虚其心，后炼精气神而得其身”，最后达到“性命双全、形神俱妙”。

　　李道纯也是内丹学大家，融合南北二宗 ，特别强调“守中”是内丹核心，认为此“中”即是玄关一窍。

　　李道纯的著述甚多，主要有《道德会元》、《三天易髓》、《全真集玄秘要》、《太上升玄消灾护命妙经注》、《太上老君说常清静经注》等，后人集其言论为《清庵莹蟾子语录》和《中和集》。