Celera公司测出老鼠基因组序列
尽管老鼠基因的破译丝毫不比人类基因的破译容易,而且在寻找基因与疾病关系的工作中,老鼠的基因同样重要,不过,当位于美国马里兰州的Celera基因数据公司4月27日宣布它已经测出并收集到老鼠的全部基因数据时,新闻并没有引起哄动。Celera受到冷落的部分原因可能是这样一个事实:如果科学家们没有付出相当的费用,他们就不可能看到这些来自于一项重要研究的数据。 据美国科学杂志在线新闻报道,Celera公司的总裁J.CraigVenter明确表示,他不打算将研究结果发表在科学期刊上。Venter说Celera公司将“自己出版”一份报告来描述它的工作。但是,任何希望看见原始数据的人都需要向Celera公司购买。公司发言人HeatherKowalski拒绝说明费用是多少,他指出费用可以逐家进行讨价还价。Celera公司目前的订户也不能自动地看到老鼠的基因数据;他们需要购买“升级”功能才能看到这些数据。 Celera公司从去年4月起开始从3种老鼠(129xl/SvJ,DBA/2J,A/J)身上收集遗传物质DNA数据。今天,Celera公司说它已积累了159亿个碱基对的原始数据,这相当于老鼠全部DNA数据的6倍。也就是说这些数据将足够生物信息学家们拼接出老鼠的基因组。Celera公司说它测出的26亿个非重复DNA的碱基对数据约占老鼠基因组的99%。公司的官员说他们没有依赖老鼠的公共基因组数据,这样可以为他们的“霰弹法”(shotgun)战略是否可信提供有力的证据。霰弹法更多是依赖于计算机而不是DNA图形来绘制出基因组的结构。 使用超级计算机和适当的软件,Celera公司将零散的DNA数据拼接成整体,公司说这些组合起来的数据组是具有很好次序的、自洽的结构,他们声称所获得的95%的DNA片段的长度在10万个碱基对以上,80%的DNA片段的长度在100万个碱基对以上。对研究人员来说,至少是那些能付清费用的研究人员来说,这种高度的接近性将帮助他们鉴别新的基因并确定出它们的功能。
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